1989年2月份，习仲勋在深圳市委副书记秦文俊的陪同下视察正在建设的深圳市委党校，看了教室和图书馆以后，他对兼职校长的秦文俊谈了几点看法，赞许他这位市委领导兼职党校校长的举措是对的。他听副校长梁忠桓汇报说党校的教师都是挑选和考试调入，便说，深圳搞改革开放，现在的干部队伍特别是科技干部少，素质不高，小平办特区，就要方方面面走在全国前面， 靠我们这些大老粗不行 ，需要高科技的人才，党校是培养各级领导干部的基地。深圳的领导干部要从市区县来的多面人才，懂政治也要懂经济，工农商都要懂、都要学，这样干部才成长的快。他对秦文俊说： 你的责任重大、任务艰巨，不可掉以轻心啊！
他开玩笑说，希望深圳市委党校，办成抗大式(指延安 抗日军政大学 )的学校，成为全国党校的先行者，争当各级党校的排头兵。 文俊你行不行？ 看到秦文俊笑而不答，他说，我希望如此，当然能不能是你的事。
曾经，深圳特区的建设遭到过不少非议。有一次他在深圳转了很久，很高兴的说，现在的深圳是生机勃勃、热火朝天向前发展，改革开放这条路只能向前走，不能回头。但话说起来容易做起来难，深圳也是多少人做了多少工作，不容易。 小平种的这个试验田，现在长的苗又壮又肥，这条路是对的，一定要走下去。
他对时任深圳市委书记的李灏说： 李灏啊，不要听人今天说这个明天说那个，深圳是中国特色的社会主义的榜样。 见到李灏笑他就很高兴，一旦见到他不说话，他就哈哈一笑说，我就知道你一定又遇到困难了。他说，我们这些老人没有决策权了，但还是会支持特区，为深圳的发展呼吁、说话、建言献策。
高度评价梁湘，称赞那代领导班子是一代 实干的班子
习仲勋很喜欢享受天伦之乐，在子女还小的时候亲自给子女洗衣服、做饭，并以此为乐，但他对子女的教育是非常严格的。他对子女们包括对女婿的要求就是：要忠诚于党，不要怪组织，不要靠老子，路要自己走。
张国英多次听到他对说： 近平，不管你当多大的官，不要忘记勤勤恳恳为人民服务，真真切切为百姓着想，要联系群众，要平易近人，对干部有毛病有错误，要先跟他打招呼让他改，要是他还是不改那就是另外一回事了。批评教育要从严，但要给人出路。 他的两个儿子近平和远平都很象他，他教育儿子们生活上要艰苦朴素，不要挑挑拣拣，老百姓能吃的你们就能吃。对习近平下放那几年的表现，习仲勋表示 不错 ，自己很满意。
习仲勋曾被这样评价： 他是一个政治家，这个人能实事求是，是一个活的马克思主义者。 无论是在文革后为一些干部平反昭雪，还是在特殊时期，他的表现都如同一个严格的慈父。
1990年，习仲勋就法律、纪律的问题，专门与深圳市纪委书记李海东谈了一次话，他说，纪律严字当头，但也要宽以待人，一个人犯了错误要给他空间改正，党和国家培养一个干部不容易，倒掉一个却很容易。他语重心长的对李海东说： 你作为纪委书记，也要刀下留人呐！ 他嘱咐，有些事要深入调研，不要凭一封匿名信就定论，凡是匿名信一定要查个水落石出，党的历史上是有过严重的教训的，杀人之前要通过纪检会。他认为，对干部首先是要保护，批评教育要从严，处理则要从宽。
他对梁湘的评价非常高，非常欣赏他。他曾经说，梁湘敢闯敢杀，不怕死不怕丢官，是个人才。梁湘住院时，他多次派人去看望。在审查梁湘时，他对审查组组长说，对待梁湘要有历史的公道，对一个老干部要全面的看，要看他一贯的历史，不要因为某些问题把干部全盘否定、打翻在地，再也不能翻身。 深圳发展的这么好，如果没有梁湘的实干，哪里有今天？他们这代班子就是个实干的班子，敢闯敢拼。
直到现在，习仲勋的夫人齐心依然关心着梁湘的夫人邝辉军 她们曾是抗大的同学。今年春节，她还托张国英去问候邝辉军。
在深圳的12年晚年生活
大家都知道习仲勋与深圳有着不解之缘，但很少有人知道，他是在深圳度过的晚年。
1990年9月底，退居二线的习仲勋在中央办公厅副主任杨德忠的陪伴下来深圳看牙疾，是张国英去接的。当时老人一来就说，深圳打开了国门，看到了香港看到了世界，是了不起的事，小平同志的伟大就在这里， 现在我退居二线了，就要在深圳住下去，在深圳恢复我的健康。深圳是我的家，我要看着深圳发展。 除了在珠海短暂住了一阵，整整12年，他都在深圳度过。